안녕하세요 메시어스입니다.

해당 현상의 경우, 일반적으로 누적막대형 같은 차트 유형이 원인이기 보다는 아래 이미지와 동일한 binding 값으로 설정된 series 이기 때문에 동일한 series 색상을 가지게 됩니다.

따라서 해당 색에 대한 구별을 위해 데이터가 series에 동일한 binding 값으로 설정되어 있다면 다른 key 값으로 변경하시기 바랍니다. 

혹은 차트의 palette 값이 아래 코드와 같이 하나의 값으로만 설정되어 있는지도 확인 및 별도의 색상 값을 추가해보시기 바랍니다.

let barchart = new chart.FlexChart('#chart', {
   (...)
   palette: ['rgba(42,159,214,1)']
});

만일 데이터 변경이 어려우시거나 palette 값이 이미 여러 개로 설정되어 있는 경우, 차트가 렌더링이 끝난 후 발생하는 rendered 이벤트 내에서 seriesGroup을 접근하여 rect 요소의 색상을 변경처리 할 수 있습니다.

let barchart = new chart.FlexChart('#chart', {
   (...)
        rendered:function(s,e){
            var seriesGroup = document.querySelector(".wj-series-group").childNodes[0].childNodes
            seriesGroup[0].style.fill = "red"
            seriesGroup[1].style.fill = "green"
        }
})

다른 궁금한 점이 생기면 문의주시기 바랍니다.

감사합니다.

메시어스 드림